Die präsente Geschichte des Protestantismus in Lyon ist eng mit der Stadt selbst verwoben, und ihre Wurzeln reichen tief in das 16. Jahrhundert zurück. Nach der Reformation erhielten die ersten reformatorischen Ideen durch Bekennerische Händler und Gewerbetreibende langsam Anklang. Lyon, als wichtiges Handelszentrum, bot eine vorteilhafte Umgebu